Agile development for Bioinformatics

행사 기간
2008년 07월 28일 (월요일) 오전 12:00~
2008년 08월 02일 (토요일) 오전 12:00
등록 기간
2008년 07월 07일 (월요일) 오전 12:00~
2008년 07월 28일 (월요일) 오전 12:00
담당자
Kyoohyoung Rho(krho.myopenid.com)님
행사 장소
이화여대(신세계관)
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등록 현황 행사 요약
  • 정원 : 30명 (전체 30명 등록, 0명 대기)
  • 기본그룹 : 30명 (30명 참석, 0명 대기)
  • 본 이벤트는 무료로 진행되는 이벤트 입니다.
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    Tag Bioinformatics, Cheminformatics, Agile development, Extreme programming
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    2008 생물정보학 교육 워크샵:
     
    * 제목 : "Agile development for Bioinformatics"
    * 기간 : 2008.07.28(월) ~ 08.02(토) (총 5.5일)
    * 장소 : 이화여대 (신세계관)
    * 교육비 : 70만원 (후원기관 지원 : 70만원)
    * 인원 :  20명   30명 
    (연구자들의 관심과 호응을 반영하여 30명으로 증원하였습니다.)
    * 주관 : 이화여대 시스템생물학 연구소 & 서울대 생명의약네트워크 연구정보센터 (i-pharm)
    * 후원 : 교육부 수도권 대학특성화 지원사업(이화여대), 국가지정 전문연구정보센터 사업(서울대)

    * 대상 :
     1. 생물정보학 1과제 연구팀 (및 공동 연구자)
     2. 생물정보학 2,3,4 과제 연구팀 중 희망자
     3. 생물정보학 (또는 화학정보학) 관련분야 연구자
    * 외부 공개 여부 : 공개 (등록비 없음)
    * 목적 : 중급자를 대상으로 협동(함께 일하기)을 통한 실제 구현 능력의 향상 

    * 1, 2번 대상자가 아닌 경우 죄송합니다만 생물정보학(화학정보학) 관련 연구자로 제한합니다.
     o 학교의 경우 소속을 적으실 때 연구실 이름까지 적어주시기 바랍니다. (혹은 학과 이름)      
     o 회사의 경우 관련 연구 부서임을 알 수 있도록 부서 이름을 적어주시기 바랍니다.              

    * 다루는 주요 내용
     o TDD (Test driven development) / Unit Test / Refactoring
     o Pair programming / Code review

    기획 단계에서는 생물정보학 1과제 연구팀의 교육 워크샵으로 준비되었습니다만
    좋은 것을 함께 나누고 공동연구 문화가 확산되었으면 하는 바람으로
    외부에 공개하고 관련분야의 연구자들을 워크샵에 초대하게 되었습니다.
    실제 연구 환경에서 공동연구 - 특히 소프트웨어 개발을 잘 할 수 있는 연구 문화는
    어떤 것인지 배우고 느끼는 시간이 되길 바랍니다.

    * 문의사항 : 노규형 (
    kyoohyoung.rho@gmail.com)

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    워크샵 교육 내용(초안):

    * 교육 시간 : 월~금 6시간, 토요일 4시간

    월요일:
     * Ice Breaking 0.5h : 팀워크를 기른다 (dramatherapy의 기법들을 쓸 예정)
     * Ground Rule Setting 0.5h : 워크샵 기간 동안 우리가 지켜야할 기본 규칙을 정한다
     * 소프트웨어 개발 개론 1h : 소프트웨어 개발이란 무엇이고 어떤 일들이 있나, 무엇이 중요한가
     * Pair Programming 1.5h : 짝 프로그래밍을 잘 하는 방법 실습
     * 프로젝트 회고 1h : 실제 지난 1년간 프로젝트 진행에 대한 회고 진행
     * 액션 플랜 뽑기 0.5h : 앞으로 우리 팀이 지켜야할 액션 플랜 정하기
     * 버퍼 1h

    화요일:
     * user story, requirement gathering/analysis 1.5h : 현 프로젝트의 요구사항 분석, 사용자 스토리 작성
     * 전체 Planning Game 2h : 남은 2년 동안에 대한 대략적 플래닝 게임
     * Iteration Planning/Review 1h : 다음 반복주기(1주? 1달?)에 대한 계획 및 리뷰 방식 정하기
     * 개발을 쉽게 하는 제 일 원칙 1h : 작동하는 소프트웨어 상태를 유지하기. 실습
     * 버퍼 0.5h

    수요일:
     * 탐험적 접근법, 디버깅 1h : 탐험적으로 프로그래밍, 테스팅, 디버깅 하는 방법. 효과적으로 사고하는 법
     * 리팩토링 1h : 코드의 엔트로피 낮추기
     * 자동화 2h : 테스트 자동화, 반복적 업무 자동화 기술, 전략
     * TDD 1h : 테스트 주도 개발. 실습
     * 버퍼 1h

    목요일:
     * TDD 2h : 테스트 주도 개발 고급(mocking). 실습
     * 설계 1h : 좋은 설계란? 가벼운 설계 기법(CRC 카드 등)
     * Continuous Integration 1h : 분산 개발(지역적으로 떨어진 사람들이 함께 개발) 경우 CI가 필수적.
    간단한 CI를 직접 설계하고 만들어 돌려본다.
     * 회의법 1h : 효과적으로 협력적 회의를 하는 방법
     * 버퍼 1h

    금요일:
     * 파일럿 프로젝트 3h : 현 프로젝트의 핵심에 해당하는 부분을 3시간 만큼만 도려내어서 공동 개발
     * 회고 1h : 파일럿 프로젝트 분석 및 문제점 분석, 액션 플랜 정하기
     * 파일럿 프로젝트 2차 1/2 1.5h : 이전 파일럿 프로젝트의 산출물을 모두 버리고 새로 시작. 똑같은 내용, 대신 더 똑똑한 사람들이 더 나은 방법을 쓴다.
     * 버퍼 0.5h

    토요일:
     * 파일럿 프로젝트 2차 2/2 1.5h
     * 파이럿 프로젝트 최종 회고 0.5h
     * 워크샵 전체 회고 및 질답 0.5h
     * 프로젝트 액션 플랜 정하기 0.5h : 프로젝트 전체 기간 동안 우리가 지켜야 할 것, 꼭 해야할 것들 정하기
     * 다음 반복주기 재 플래닝 0.5h : 그 동안 우리가 경험한 것을 토대로 화요일날 했던 다음 반복주기 계획을 업데이트
     * 버퍼 0.5h (교육 평가?)

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    등록현황
    • 정원 : 30명 (전체 30명 등록, 0명 대기)
    • 기본그룹 : 30명 (30명 참석, 0명 대기)

    참석자명단

    기본그룹

    → 등록자명단
    번호 이름 소속 블로그
    1 양준석 iDB Lab., SNU
    2 남승윤 이화여대 생물정보학 실험실
    3 이순명 서울대 iRGB
    4 배태정 SNU iRGB
    5 이지현 서울대학교 iRGB
    6 임혜원 서울대학교 IDB Lab.
    7 서채화 이화여대 시스템생물학 연구소
    8 장영준 서울대학교 IRGB
    9 서지혜 이화여대 생물정보학 연구실
    10 신영아 이화여대 생물정보학 연구실
    11 이상현 이화여대 생물정보학 연구실
    12 이희숙 서울대 iRGB
    13 이지순 이화여자대학교 시스템 생물학 연구소
    14 정민채 이화여대 생물정보학 연구실
    15 윤서연 이화여대 생물정보학 연구실
    16 오태윤 연세대학교 의과대학 의과학과 박사과정 (내과학교실)
    17 김종광 한양대 bioinformatics 연구실
    18 홍승표 한국과학기술원 Protein Bioinformatics Lab.
    19 이소영 KAIST 단백질생물정보학 연구실
    20 임원철 동국대학교 분자유전학 실험실
    21 이창준 연세대 생명공학과 computational systems biology lab.
    22 김택균 Postech, Systems Biology and Computational Biology Lab.
    23 김세환 디지탈지노믹스(epigenomics analysis team)
    24 정종영 연세대학교 Computational Systems Biology Lab
    25 노시훈 서울대학교 약학대학/지식 기반 약물 연구 센터
    26 강영묵 연세대학교 생명공학 Computational Systems Biology Lab
    27 안희성 KAIST 단백질정보연구실(Protein Bioinfomatics Lab)
    28 구남진 KAIST Bio-Information System Lab.
    29 이윤호 국립 경상대학교 생물정보학 연구실
    30 김보라 ewha systems biology lab.

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    연구자들의 관심과 호응을 반영하여 30명으로 증원하였습니다.

    2008-07-17 오전 10:57:47  by Kyoohyoung Rho  |  덧글 (0)

    몇 시 부터 시작하나요?

    2008-07-21 오후 12:07:50  by 정종영  |  덧글 (0)

    김창준 코치님과 논의해서 결정이 되는대로 공지하도록 하겠습니다. (아마도 9시부터 시작하지 않을까 싶습니다만...)

    2008-07-21 오후 1:31:00  by Kyoohyoung Rho  |  덧글 (0)

    워크샵 공지 사항 #1입니다. 1. 워크샵 전 간단한(?) 설문조사를 이메일로 보낼예정입니다. 이메일이 기록되어 있지 않은 분은 기록해주시기 바랍니다. 2. 워크샵 교육시간은 아래와 같습니다. 아침 출근 시간대/점심식사 시간대를 피하기 위해 10:00 - 12:30 : 오전 수업 12:30 - 13:30 : 점심 식사 13:30 - 17:00 : 오후 수업 17:00 - 18:00 : 복습 및 과제(코치 없이) 3. 지하철역에서 이화여대 신세계관으로 오시려면 (1) 지하철 2호선 이화여대 역 하차 (2) 이화여대 정문 통과 (3) 박물관을 끼고 왼쪽길로 (4) 기숙사를 통과해서 초등학교 담길에서 오른쪽길로 (5) 큰 길까지 나가면 바로 신세계관 건물.

    2008-07-22 오후 3:11:46  by Kyoohyoung Rho  |  덧글 (0)

    메일로 보내드린 설문조사에 답변을 주시면 참가 가능한 것으로 알겠습니다.

    2008-07-24 오전 10:18:09  by Kyoohyoung Rho  |  덧글 (0)

    이메일을 기록하지 않으셔서 설문조사 메일을 못 받으신 분들은 일단 메일을 등록해주시고, 제게 메일을 한 통 보내주시기 바랍니다.

    2008-07-24 오후 1:54:17  by Kyoohyoung Rho  |  덧글 (0)

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    멤피스의 생각 2008-07-12 오전 6:21:50
    Agile development for Bioinformatics : 온오프믹스(http://www.onoffmix.com) 재밌겠는데 조건이랑 시간이 안 맞네
    -gwLee's blog
    2008 생물정보학 교육 워크샵 2008-07-15 오후 8:32:47
    * 제목 : "Agile development for Bioinformatics" * 일정 : 2008.07.28(월) ~ 08.02(토) (총 5.5일) * 장소 : 이화여대 (신세계관) * 교육비 : 없음. * 인원 : 20명 * 주관 : 이화여대 시스템생물학 연구소 & 서울대 생명의약네트워크 연구정보센터 * 후원 : 교육부 수도권 대학특성화 지원사업 (이화여대), 국가지정 전문연구정보센터 사업 (서울대) 이대 시스템 생물학 연구소, 서울대 생명..
    -hyeshik's me2DAY
    퍼키군의 생각 2008-07-21 오후 10:35:06
    7월 27일부터 8월 2일까지 Agile development 워크샵 일로 서울에 있어요~* 재미있는 일이 저녁에 있으면 불러주세요. ^_^;

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